1  Ievads

Veidojot attēlus ggplot2 sistēmā, var izmantot divas funkcijas: qplot() vai ggplot(). Pirmā funkcija ir paredzēta ātrai attēla veidošanai, bet tai ir mazākas iespējas tikt modificētai, tāpēc šīs grāmatas ietvaros tā netiks izmantota.

Šajā grāmatā visi piemēri balstīsies uz funkciju ggplot(). Šai funkcijai kā pirmais arguments ir jānorāda datu tabula/rāmis (var arī nenorādīt, bet tad tā jānorāda kā arguments geom_...() vai stat_...() funkcijās). Šis objektam būtu jābūt tādam, ko programma R uztver kā data frame. Nākamie argumenti ir x un y vērtības, kā arī citi mainīgie, ja no tiem ir jābūt atkarīgai krāsai, formai, utt. Visi mainīgie tiek norādīti funkcijā aes(). Ir jāatceras, ka aes() jānorāda tikai mainīgā (kolonnas) nosaukums, neliekot to pēdiņās, kā arī neizmantojot pieraktu dati$mainigais. Pieraksts ar $ zīmi var radīt dīvainu (nepareizu rezultātu).

Funkcijā aes() nav obligāti rakstīt x =... un y =... - trūkstot šiem argumentiem, pirmais mainīgais tiks uztverts kā x, bet otrais kā y.

1.1 Dati

ggplot2 sistēmas iespēju apskatīšanai izmantoti R iekļautie datu objekti CO2 un mpg (iekļauts pakotnē ggplot2). CO2 ir eksperimenta rezultāti par sala tolerenaci sugai Echinochloa crus-galli.

Datu objektā ir piecas kolonnas:

  1. Plant - auga identifikators;
  2. Type - auga izcelsmes vieta;
  3. Treatment - eksperimenta apstākļi (divas kategorijas);
  4. conc - vides CO2 koncentrācija;
  5. uptake - uzņemtā CO2 apjoms.
data(CO2)
head(CO2)
  Plant   Type  Treatment conc uptake
1   Qn1 Quebec nonchilled   95   16.0
2   Qn1 Quebec nonchilled  175   30.4
3   Qn1 Quebec nonchilled  250   34.8
4   Qn1 Quebec nonchilled  350   37.2
5   Qn1 Quebec nonchilled  500   35.3
6   Qn1 Quebec nonchilled  675   39.2

Objektā mpg ir informācija par degvielas patēriņu, kas pārādīta 11 kolonnās:

  1. manufacter - ražotājs;
  2. model - automašīnas modelis;
  3. displ - dzinēja tilpums;
  4. year - ražošanas gads;
  5. cyl - cilindru skaits;
  6. trans - transmisijas tips;
  7. drv - velkošie riteņi;
  8. cty - jūdžu skaits/gallons pilsētā;
  9. hwy - jūdžu skaits/gallons uz šosejas;
  10. fl - degvielas veids;
  11. class - automašīnas veids.
library(ggplot2)
data(mpg)
head(mpg)
# A tibble: 6 × 11
  manufacturer model displ  year   cyl trans      drv     cty   hwy fl    class 
  <chr>        <chr> <dbl> <int> <int> <chr>      <chr> <int> <int> <chr> <chr> 
1 audi         a4      1.8  1999     4 auto(l5)   f        18    29 p     compa…
2 audi         a4      1.8  1999     4 manual(m5) f        21    29 p     compa…
3 audi         a4      2    2008     4 manual(m6) f        20    31 p     compa…
4 audi         a4      2    2008     4 auto(av)   f        21    30 p     compa…
5 audi         a4      2.8  1999     6 auto(l5)   f        16    26 p     compa…
6 audi         a4      2.8  1999     6 manual(m5) f        18    26 p     compa…

1.2 Attēlu saglabāšana

ggplot2 sistēmā izveidoto attēlu saglabāšanu var veikt ar funkciju ggsave(), kuru izpilda pēc attēlā izveidošanas un kurā kā pamatarguments ir jānorāda vēlamais attēlā nosaukums ar nepieciešamo paplašinājumu (png, eps, ps, tex, pdf, jpeg, tiff, bmp, svg, wmf (tikai uz windows)). Papildus var norādīt attēla izmēru (width= un height=). Pēc noklusējuma izmērs ir collās, bet var mainīt uz cm vai mm ar argumentu units=. Arguments dpi= rastra tipa attēliem maina izšķirtspēju.

library(ggplot2)
data(CO2)
ggplot(CO2, aes(conc, uptake)) + geom_point()
ggsave("Attels_1.png", width = 10, height = 6, units = "cm")

Ja attēls ir ticis saglabāts sesijas laikā kā objekts (mainīgais), tad to var saglabāt ar funkciju ggsave() norādot argumentu plot =.

attels_1 <- ggplot(CO2, aes(conc, uptake)) + geom_point()
ggsave("Attels_1.png", plot = attels_1, width = 10, height = 6, units = "cm")